サイエンスチャレンジは、授業を離れて、様々な「科学」に挑戦する講座です。「好奇心」がある人ならば、誰でも参加できます。多くはサタデープロジェクト（サタプロ）枠内での開催ですが、放課後や夏休みに行われる場合もあります。この３月に卒業した先輩も「自分の進路ややりたいことを明確にするのにとても役立った」「今になって参加することの大切さを知ったから、もっと大事さを考えるべき」とアンケートで答えてくれた、イチオシのSSH企画です。年度末にはサイエンスチャレンジ・サタデープロジェクト等の課外活動に最も多く参加した生徒を「洛北アクティブラーナーアワード」として表彰しています。