（令和５年４月１日現在）
| 区別 | 種別 | 地域 | 名称 | 員数 | 時代 | 指定等年月日 | 所有者等 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 府指定 | 絵画 | 京都市北区 | 絹本著色寛空僧正像 | １幅 | 平安 | 1990(H2).4.17 | 上品蓮台寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市北区 | 紙本著色遊行上人縁起絵 | 20巻 | 室町 | 1999(H11).3.19 | 金蓮寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市北区 | 絹本著色浄阿真観像 | １幅 | 南北朝 | 2005(H17).3.18 | 金蓮寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市北区 | 絹本著色虚堂智愚像 | １幅 | 南宋 | 2010(H22).3.23 | 瑞峯院 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市上京区 | 紙本著色日像像 | １幅 | 南北朝 | 2000(H12).3.17 | 妙顕寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市上京区 | 絹本著色絵曼荼羅 | １幅 | 南北朝－室町 | 2000(H12).3.17 | 法華寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市上京区 | 絹本著色日吉山王垂迹神曼荼羅図 | １幅 | 鎌倉 | 2008(H20).3.21 | （社）京都當道会 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市上京区 | 絹本著色日吉山王本地仏曼荼羅図 | １幅 | 南北朝 | 2008(H20).3.21 | （社）京都當道会 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市上京区 | 絹本著色束帯天神像（根本御影） | １幅 | 南北朝～室町 | 2014(H26).3.24 | 北野天満宮 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市上京区 | 絹本著色束帯天神像（遺教院伝来） | １幅 | 南北朝～室町 | 2014(H26).3.24 | 北野天満宮 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市上京区 | 絹本著色虎図 陶佾筆 | １幅 | 明（中国） | 2023(R5).3.24 | 報恩寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市左京区 | 絹本著色阿弥陀聖衆来迎図 | １幅 | 鎌倉 | 1984(S59).4.14 | 三千院 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市左京区 | 絹本著色熊野垂迹曼荼羅図 | １幅 | 鎌倉 | 2006(H18).3.17 | 聖護院 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市左京区 | 絹本著色法然上人像 | １幅 | 鎌倉 | 2009(H21).3.24 | 金戒光明寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市中京区 | 絹本著色地蔵十王図 | 11幅 | 南宋 | 1984(S59).4.14 | 誓願寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市中京区 | 紙本著色壬生地蔵縁起 | ６巻 | 室町 | 2019(H31).3.29 | 壬生寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市東山区 | 絹本著色八幡若宮神像 | １幅 | 鎌倉 | 1992(H4).4.14 | 栗棘庵 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市東山区 | 絹本著色石清水八幡宮曼荼羅図 | １幅 | 鎌倉 | 1992(H4).4.14 | 栗棘庵 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市東山区 | 絹本著色興教大師像 | １幅 | 鎌倉－南北朝 | 2001(H13).3.23 | 智積院 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市東山区 | 紙本墨画淡彩寒山拾得図 | ２幅 | 室町 | 2007(H19).3.16 | 東福寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市東山区 | 紙本著色総持正傑像 | １幅 | 南北朝 | 2011(H23).3.25 | 禅居庵 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市東山区 | 絹本著色十王図 陸信忠筆 | 10幅 | 元（中国） | 2022(R4).3.22 | 六波羅蜜寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市東山区 | 絹本著色双鶴図 陳伯冲筆 | １幅 | 明～清（中国） | 2023(R5).3.24 | 本山龍池山大雲院 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市下京区 | 絹本著色存覚上人像 | １幅 | 南北朝－室町 | 1985(S60).5.15 | 常楽寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市下京区 | 紙本著色善信上人親鸞伝絵 | ２巻 | 室町 | 1998(H10).3.13 | 仏光寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市下京区 | 絹本著色親鸞聖人像 | １幅 | 南北朝 | 2011(H23).3.25 | 常楽寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市南区 | 絹本著色不動明王三童子像 | １幅 | 鎌倉 | 2017(H29).3.17 | 教王護国寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市南区 | 絹本著色弘法大師像（観智院伝来） | １幅 | 鎌倉 | 2017(H29).3.17 | 教王護国寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市南区 | 絹本著色弘法大師像（宝菩提院伝来） | １幅 | 鎌倉 | 2017(H29).3.17 | 教王護国寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市右京区 | 絹本著色徳川市姫像 | １幅 | 桃山 | 1988(S63).4.15 | 清凉寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市右京区 | 絹本著色渡辺正栄尼像 | １幅 | 桃山 | 1989(H1).4.14 | 清凉寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市右京区 | 絹本著色僧形八幡神像 （互御影） | １幅（２幅） | 鎌倉 | 1992(H4).4.14 | 神護寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市右京区 | 絹本著色弘法大師像 | １幅（２幅） | 鎌倉 | 1992(H4).4.14 | 神護寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市右京区 | 絹本著色八幡垂迹曼荼羅図 | １幅 | 鎌倉 | 1993(H5).4.9 | 龍安寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市右京区 | 絹本著色妙音天像 | １幅 | 室町 | 2015(H27).3.24 | 仁和寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市伏見区 | 紙本著色高祖大師秘密縁起 | 10巻 | 室町 | 2019(H31).3.29 | 安楽寿院 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市山科区 | 覚禅鈔 | 164巻 | 鎌倉・南北朝 ・江戸 | 2006(H18).3.17 | 勧修寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京都市山科区 | 紙本著色日蓮聖人註画讃 | ５巻 | 室町 | 2019(H31).3.29 | 本圀寺 |
| 府指定 | 絵画 | 長岡京市 | 絹本著色紅玻璃阿弥陀像 | １幅 | 鎌倉 | 1995(H7).3.14 | 楊谷寺 |
| 府指定 | 絵画 | 長岡京市 | 絹本著色阿弥陀如来像 | １幅 | 鎌倉 | 1997(H9).3.14 | 楊谷寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京田辺市 | 絹本著色南浦紹明像 | １幅 | 鎌倉 | 2018(H30).3.23 | 酬恩庵 |
| 府指定 | 絵画 | 京田辺市 | 絹本著色一休宗純像 | １幅 | 室町 | 2018(H30).3.23 | 酬恩庵 |
| 府指定 | 絵画 | 京田辺市 | 絹本著色一休宗純像（朱太刀像） | １幅 | 室町 | 2018(H30).3.23 | 酬恩庵 |
| 府指定 | 絵画 | 木津川市 | 絹本著色釈迦三尊十六羅漢図 | ３幅 | 南北朝 | 1986(S61).4.15 | 海住山寺 |
| 府指定 | 絵画 | 木津川市 | 絹本著色春日宮曼荼羅十六善神図 | １幅 | 鎌倉 | 2002(H14).3.26 | 海住山寺 |
| 府指定 | 絵画 | 笠置町 | 紙本著色笠置寺縁起 | ３巻 | 室町 | 2016(H28).3.18 | 笠置寺 |
| 府指定 | 絵画 | 和束町 | 絹本著色和束天神縁起 | ４幅 | 南北朝－江戸 | 1992(H4).4.14 | 天満宮 |
| 府指定 | 絵画 | 和束町 | 絹本著色大有理有像 | １幅 | 室町 | 1997(H9).3.14 | 大智寺 |
| 府指定 | 絵画 | 南山城村 | 絹本著色星曼荼羅図 | １幅 | 鎌倉 | 2002(H14).3.26 | 真輪院 |
| 府指定 | 絵画 | 亀岡市 | 絹本著色松井雲江像 | １幅 | 室町 | 1985(S60).5.15 | 龍潭寺 |
| 府指定 | 絵画 | 亀岡市 | 板絵著色繋馬図 円山応挙・円山応瑞筆 | １面 | 江戸 | 2016(H28).3.18 | 小幡神社 |
| 府指定 | 絵画 | 亀岡市 | 絹本著色仏涅槃図 | １幅 | 南北朝 | 2020(R2).3.27 | 極樂寺 |
| 府指定 | 絵画 | 南丹市 | 絹本著色等栄信倫禅尼像 | １幅 | 室町 | 1995(H7).3.14 | 深見寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京丹波町 | 板絵著色神馬図 狩野元信筆 | １面 | 室町 | 1989(H1).4.14 | 子守神社 |
| 府指定 | 絵画 | 京丹波町 | 板絵著色竹虎図 狩野元信筆 | １面 | 室町 | 1990(H2).4.17 | 大福光寺 |
| 府指定 | 絵画 | 綾部市 | 絹本著色天庵妙受像 | ３幅 | 南北朝 | 1983(S58).4.15 | 安国寺 |
| 府指定 | 絵画 | 福知山市 | 絹本著色大中臣持実像 | １幅 | 室町 | 1984(S59).4.14 | 天寧寺 |
| 府指定 | 絵画 | 福知山市 | 絹本著色大中臣元実像 | １幅 | 室町 | 1984(S59).4.14 | 天寧寺 |
| 府指定 | 絵画 | 福知山市 | 紙本著色清園寺縁起 | ３幅 | 南北朝 | 1991(H3).4.19 | 清園寺 |
| 府指定 | 絵画 | 福知山市 | 絹本著色愚中周及像 自賛がある | １幅 | 室町 | 2007(H19).3.16 | 天寧寺 |
| 府指定 | 絵画 | 福知山市 | 絹本著色愚中周及像 霊仲禅英の賛がある | １幅 | 室町 | 2007(H19).3.16 | 天寧寺 |
| 府指定 | 絵画 | 福知山市 | 紙本墨画西湖図 如奇筆 | １幅 | 室町 | 2012(H24).3.23 | 天寧寺 |
| 府指定 | 絵画 | 福知山市 | 絹本著色愛染明王像 | １幅 | 鎌倉 | 2021(R3).3.30 | 金光寺 |
| 府指定 | 絵画 | 舞鶴市 | 絹本著色阿弥陀三尊像 | １幅 | 高麗 | 1989(H1).4.14 | 松尾寺 |
| 府指定 | 絵画 | 舞鶴市 | 絹本著色仏涅槃図 窪田統泰筆 | １通 | 室町 | 1994(H6).2.18 | 桂林寺 |
| 府指定 | 絵画 | 舞鶴市 | 報恩寺本堂障壁画 文麟筆 | 44面 | 江戸 | 2013(H25).3.19 | 報恩寺 |
| 府指定 | 絵画 | 宮津市 | 絹本著色釈迦三尊像 | １幅 | 南北朝 | 1984(S59).4.14 | 智恩寺 |
| 府指定 | 絵画 | 宮津市 | 絹本著色地蔵菩薩像 | １幅 | 南北朝 | 1984(S59).4.14 | 智恩寺 |
| 府指定 | 絵画 | 宮津市 | 紙本墨画風竹図 与謝蕪村筆 六曲屏風 | １隻 | 江戸 | 1986(S61).4.15 | 江西寺 |
| 府指定 | 絵画 | 宮津市 | 紙本著色草花図 | 20面 | 江戸 | 2004(H16).3.19 | 智源寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京丹後市 | 絹本著色当麻曼荼羅図 | １幅 | 南北朝 | 1983(S58).4.15 | 本願寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京丹後市 | 絹本著色松井康之像 | １幅 | 江戸 | 1988(S63).4.15 | 宗雲寺 |
| 府指定 | 絵画 | 京丹後市 | 絹本著色松井与八郎像 | １幅 | 桃山 | 1988(S63).4.15 | 宝泉寺 |
| 府指定 | 絵画 | 伊根町 | 紙本著色浦嶋明神縁起（掛幅本） | １幅 | 室町－江戸 | 1999(H11).3.19 | 宇良神社 |
| 府指定 | 絵画 | 与謝野町 | 紙本墨画方士求不死薬図 与謝蕪村筆 六曲屏風 | １双 | 江戸 | 1986(S61).4.15 | 施薬寺 |
| 府指定 | 絵画 | 与謝野町 | 紙本墨画淡彩禅宗祖師図 狩野内膳筆六曲屏風 | １双 | 桃山 | 2022(R4).3.22 | 常栖寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市上京区 | 木造日蓮坐像 | １軀 | 鎌倉 | 2000(H12).3.17 | 妙覚寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市上京区 | 木造兜跋毘沙門天立像 | １軀 | 平安 | 2009(H21).3.24 | 廬山寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市左京区 | 木造伝一鎮坐像 | １軀 | 鎌倉－南北朝 | 1989(H1).4.14 | 迎称寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市左京区 | 木造竺堂円瞿坐像 | １軀 | 南北朝 | 1995(H7).3.14 | 栖賢寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市左京区 | 木造千手観音立像 | １軀（５軀） | 鎌倉 | 2019(H31).3.29 | （一財）川合京都仏教美術財団 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市左京区 | 木造不空羂索観音立像 | １軀（５軀） | 鎌倉 | 2019(H31).3.29 | （一財）川合京都仏教美術財団 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市左京区 | 木造十一面観音立像 | １軀（５軀） | 鎌倉 | 2019(H31).3.29 | （一財）川合京都仏教美術財団 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市左京区 | 木造聖観音立像 | １軀（５軀） | 鎌倉 | 2019(H31).3.29 | （一財）川合京都仏教美術財団 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市左京区 | 木造馬頭観音立像 | １軀（５軀） | 鎌倉 | 2019(H31).3.29 | （一財）川合京都仏教美術財団 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市東山区 | 木造俊ジョウ律師坐像 | １軀 | 鎌倉 | 1983(S58).4.15 | 泉涌寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市東山区 | 片山家伝来能面 | 141面 | 室町－江戸 | 2000(H12).3.17 | （公財）片山家能楽・京舞保存財団 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市東山区 | 木造毘沙門天立像 | １軀 | 南北朝－室町 | 2006(H18).3.17 | 尊勝院 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市東山区 | 木造阿弥陀如来坐像 像内にアン（梵字）アミタ仏等の銘がある | １軀 | 鎌倉 | 2022(R4).3.22 | 悲田院 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市伏見区 | 木造阿弥陀如来坐像 | １軀 | 平安 | 1984(S59).4.14 | 当麻寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市伏見区 | 木造阿弥陀如来坐像 | １軀 | 鎌倉 | 1984(S59).4.14 | 一念寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市伏見区 | 木造僧形坐像 | ２軀 | 唐 | 1988(S63).4.15 | 善願寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市伏見区 | 木造地蔵菩薩坐像 | １軀 | 平安 | 1993(H5).4.9 | 摂取院 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市西京区 | 木造聖徳太子立像 | １軀 | 鎌倉 | 1996(H8).3.15 | 宝菩提院 |
| 府指定 | 彫刻 | 京都市西京区 | 木造神像 | 16軀 | 平安～鎌倉 | 2013(H25).3.19 | 松尾大社 |
| 府指定 | 彫刻 | 長岡京市 | 木造阿弥陀如来坐像 | １軀 | 平安 | 1986(S61).4.15 | 乗願寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 長岡京市 | 木造千手観音立像 | １軀 | 平安 | 1992(H4).4.14 | 楊谷寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 長岡京市 | 木造十一面観音坐像 | １軀 | 南北朝－室町 | 1996(H8).3.15 | 観音寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 長岡京市 | 木造四天王立像 | ４軀 | 鎌倉 | 1997(H9).3.14 | 寂照院 |
| 府指定 | 彫刻 | 長岡京市 | 木造菩薩立像 | １軀 | 鎌倉 | 2021(R3).3.30 | 勝龍寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 大山崎町 | 木造慈恵大師坐像 | １軀 | 鎌倉 | 2004(H16).3.19 | 寶積寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 宇治市 | 木造男神坐像 | １軀（２軀） | 鎌倉 | 1986(S61).4.15 | 許波多神社 |
| 府指定 | 彫刻 | 宇治市 | 木造女神坐像 | １軀（２軀） | 鎌倉 | 1986(S61).4.15 | 許波多神社 |
| 府指定 | 彫刻 | 宇治市 | 木造薬師如来坐像 | １軀 | 鎌倉 | 1987(S62).4.15 | 妙光寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 宇治市 | 木造毘沙門天立像 | １軀 | 鎌倉 | 2002(H14).3.26 | 正覚院 |
| 府指定 | 彫刻 | 城陽市 | 木造地蔵菩薩坐像 | １軀 | 平安 | 1985(S60).5.15 | 念仏寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 八幡市 | 木造神像 | ４軀 | 平安－室町 | 1998(H10).3.13 | 石清水八幡宮 |
| 府指定 | 彫刻 | 八幡市 | 木造阿弥陀如来立像 | １軀 | 鎌倉 | 2011(H23).3.25 | 宝寿院 |
| 府指定 | 彫刻 | 八幡市 | 木造阿弥陀如来立像 | １軀 | 鎌倉 | 2018(H30).3.23 | 正法寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 京田辺市 | 木造牛頭天王立像 | １軀 | 平安 | 1986(S61).4.15 | 朱智神社 |
| 府指定 | 彫刻 | 京田辺市 | 木造十一面観音立像 | １軀 | 平安 | 1989(H1).4.14 | 西念寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 木津川市 | 木造薬師如来坐像 | １軀 | 平安 | 1983(S58).4.15 | 西念寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 木津川市 | 木造四天王立像 | ４軀 | 鎌倉 | 1985(S60).5.15 | 岩船寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 木津川市 | 当尾磨崖仏 阿弥陀如来及両脇侍坐像 | ３軀 | 鎌倉 | 1985(S60).5.15 | 岩船区 |
| 府指定 | 彫刻 | 木津川市 | 当尾磨崖仏 弥勒如来立像 | １軀 | 鎌倉 | 1985(S60).5.15 | 岩船区 |
| 府指定 | 彫刻 | 木津川市 | 当尾磨崖仏 不動明王立像 | １軀 | 鎌倉 | 1985(S60).5.15 | 岩船区 |
| 府指定 | 彫刻 | 木津川市 | 当尾磨崖仏 不動明王立像 | １軀 | 鎌倉 | 1988(S63).4.15 | 八幡宮 |
| 府指定 | 彫刻 | 木津川市 | 当尾磨崖仏 毘沙門天立像 | １軀 | 鎌倉 | 1988(S63).4.15 | 八幡宮 |
| 府指定 | 彫刻 | 宇治田原町 | 木造千手観音立像 | １軀 | 鎌倉 | 2007(H19).3.16 | 巌松院 |
| 府指定 | 彫刻 | 和束町 | 木心乾漆菩薩坐像 | １軀 | 奈良 | 2005(H17).3.18 | 観音寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 和束町 | 木造男神坐像 | １軀 | 平安 | 2017(H29).3.17 | 観音寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 亀岡市 | 木造如意輪観音坐像 | １軀 | 鎌倉 | 1983(S58).4.15 | 宗堅寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 亀岡市 | 木造十一面観音坐像 | １軀 | 平安 | 2008(H20).3.21 | 甘露寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 亀岡市 | 木造菩薩立像（伝聖観音像） | １軀 | 平安 | 2012(H24).3.23 | 無量寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 亀岡市 | 木造薬師如来坐像 | １軀 | 平安 | 2020(R2).3.27 | 願成寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 亀岡市 | 木造金剛力士立像 吽形像の像内に正安三年巧匠定有等の銘がある | ２軀 | 鎌倉・室町 | 2022(R4).3.22 | 金輪寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 亀岡市 | 鉄造薬師如来坐像 | １軀 | 平安後期～鎌倉 | 2023(R5).3.24 | 大圓寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 南丹市 | 木造金剛力士立像 | ２軀 | 鎌倉 | 1983(S58).4.15 | 歓楽寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 南丹市 | 木造毘沙門天立像 | １軀 | 平安 | 1992(H4).4.14 | 普門院 |
| 府指定 | 彫刻 | 京丹波町 | 木造毘沙門天立像 | １軀 | 鎌倉 | 1984(S59).4.14 | 大福光寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 京丹波町 | 木造千手観音立像 | １軀 | 平安 | 1989(H1).4.14 | 無動寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 京丹波町 | 木造不動明王坐像 | １軀 | 平安 | 1990(H2).4.17 | 新宮寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 福知山市 | 木造男神坐像 | １軀 | 平安 | 2014(H26).3.24 | 一宮神社（字一ノ宮） |
| 府指定 | 彫刻 | 舞鶴市 | 木造十一面観音坐像 | １軀 | 鎌倉 | 2010(H22).3.23 | 満願寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 舞鶴市 | 木造不動明王立像 | １軀（２軀） | 鎌倉 | 2010(H22).3.23 | 満願寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 舞鶴市 | 木造毘沙門天立像 | １軀（２軀） | 鎌倉 | 2010(H22).3.23 | 満願寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 舞鶴市 | 木造地蔵菩薩坐像 | １軀 | 平安 | 2016(H28).3.18 | 善福寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 宮津市 | 木造地蔵菩薩坐像 | １軀 | 鎌倉 | 1988(S63).4.15 | 如意寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 宮津市 | 木造大日如来坐像 康珎作 | １軀 | 江戸 | 1999(H11).3.19 | 智恩寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 宮津市 | 木造地蔵菩薩立像 | １軀 | 鎌倉 | 2015(H27).3.24 | 金剛心院 |
| 府指定 | 彫刻 | 宮津市 | 木造阿弥陀如来及両脇侍像 中尊 | １軀（３軀） | 室町 | 2019(H31).3.29 | 大谷寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 宮津市 | 木造阿弥陀如来及両脇侍像 左脇侍 | １軀（３軀） | 平安 | 2019(H31).3.29 | 大谷寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 宮津市 | 木造阿弥陀如来及両脇侍像 右脇侍 | １軀（３軀） | 平安 | 2019(H31).3.29 | 大谷寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 宮津市 | 木造不動明王坐像 | １軀 | 室町 | 2019(H31).3.29 | 大谷寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 京丹後市 | 木造薬師如来及両脇侍像 | ３軀 | 平安 | 1984(S59).4.14 | 成願寺 |
| 府指定 | 彫刻 | 京丹後市 | 木造阿弥陀如来立像 | １軀 | 鎌倉 | 1994(H6).2.18 | 本願寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市北区 | 小袖裂打敷類 | 16枚 | 明・桃山－江戸 | 1996(H8).3.15 | 真珠庵 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市北区 | 大徳寺伝法衣類 | 元・明 ・室町・江戸 | 2006(H18).3.17 | 大徳寺 | |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市上京区 | 梵鐘 | １口 | 鎌倉 | 1983(S58).4.15 | 華光寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市上京区 | 鉄燈籠 | １基 | 江戸 | 1985(S60).5.15 | 大本山妙蓮寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市上京区 | 木造扁額 額文「経王堂」伝足利義満筆 | １面 | 南北朝－室町 | 2004(H16).3.19 | 大報恩寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市上京区 | 金銅蓮華形柄香炉 | １柄 | 南北朝 | 2005(H17).3.18 | 廬山寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市上京区 | 九条袈裟 絶海中津所用 | １肩 | 明 | 2007(H19).3.16 | 長得院 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市上京区 | 二十五条袈裟 絶海中津所用 | １肩 | 明 | 2007(H19).3.16 | 長得院 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市左京区 | 梵鐘 | １口 | 鎌倉 | 1983(S58).4.15 | 峰定寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市左京区 | 黒漆塗箱形礼盤 | １基 | 平安 | 1986(S61).4.15 | 峰定寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市左京区 | 唐衣裳装束 伝東福門院所用 | 一式 | 江戸 | 2013(H25).3.19 | 霊鑑寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市中京区 | 瑞泉寺伝来表具裂（瑞泉寺裂） | 23幅 | 桃山－江戸 | 2002(H14).3.26 | 瑞泉寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市東山区 | 金銅装笈 | １背 | 室町 | 1998(H10).3.13 | 知恩院 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市東山区 | 高台寺打敷 | 12枚 | 桃山－江戸 | 1999(H11).3.19 | 高台寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市東山区 | 桐唐草文様五衣 北政所所用 | １組 | 桃山 | 2011(H23).3.25 | 妙法院 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市下京区 | 孔雀文磬 | １面 | 鎌倉 | 1984(S59).4.14 | 中堂寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市右京区 | 梵鐘 | １口 | 室町 | 1984(S59).4.14 | 清凉寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市右京区 | 九条袈裟 義天玄承所用 | １肩 | 明 | 2016(H28).3.18 | 龍安寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市右京区 | 九条袈裟 春屋妙葩所用 | １肩 | 元 | 2018(H30).3.23 | 曇華院 |
| 府指定 | 工芸品 | 京都市山科区 | 梵鐘 | １口 | 鎌倉 | 1983(S58).4.15 | 安祥寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 宇治市 | 梵鐘 | １口 | 建武2 （1335） | 1983(S58).4.15 | 地蔵院 |
| 府指定 | 工芸品 | 八幡市 | 鰐口 | １口 | 鎌倉 | 1985(S60).5.15 | 神應寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 八幡市 | 雲版 | １面 | 南北朝－室町 | 1986(S61).4.15 | 本妙寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 木津川市 | 梵鐘 | １口 | 鎌倉 | 1983(S58).4.15 | 海住山寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 木津川市 | 木造扁額 額文「海住山寺」 | １面 | 鎌倉 | 1992(H4).4.14 | 海住山寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 木津川市 | 木造扁額 額文「海住山寺」 | １面 | 鎌倉 | 1992(H4).4.14 | 海住山寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 木津川市 | 金銅能作性塔 | １基 | 鎌倉 | 2022(R4).3.22 | 海住山寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 木津川市 | 木造彩色宝珠台 | １基 | 鎌倉 | 2022(R4).3.22 | 海住山寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 精華町 | 梵鐘 | １口 | 鎌倉 | 1983(S58).4.15 | 極楽寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 亀岡市 | 鰐口 | １口 | 南北朝－室町 | 1991(H3).4.19 | 金輪寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 亀岡市 | 石燈籠 | １基 | 鎌倉 | 1994(H6).2.18 | 薭田野神社 |
| 府指定 | 工芸品 | 南丹市 | 鰐口 | １口 | 室町 | 1997(H9).3.14 | 普濟寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 綾部市 | 鰐口 | １口 | 南北朝－室町 | 1991(H3).4.19 | 宝蔵寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 綾部市 | 鰐口 | １口 | 室町 | 1991(H3).4.19 | 光明寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 福知山市 | 愚中周及関係遺品 | 室町・元 | 1989(H1).4.14 | 天寧寺 | |
| 府指定 | 工芸品 | 福知山市 | 木造扁額 額文「正二位聖大明神」 | １面 | 鎌倉 | 1992(H4).4.14 | 庵我神社 |
| 府指定 | 工芸品 | 舞鶴市 | 鰐口 | １口 | 室町 | 1991(H3).4.19 | 千手院 |
| 府指定 | 工芸品 | 舞鶴市 | 石燈籠 | １基 | 南北朝－室町 | 1996(H8).3.15 | 八幡神社 |
| 府指定 | 工芸品 | 宮津市 | 孔雀文磬 | １面 | 室町 | 1984(S59).4.14 | 成相寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 宮津市 | 木造扁額 額文「萬福寺」 | １面 | 南北朝－室町 | 1992(H4).4.14 | 智恩寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 京丹後市 | 熊野十二社権現懸仏 | ２面 | 鎌倉 | 1983(S58).4.15 | 圓頓寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 京丹後市 | 金銅装笈 | １背 | 室町 | 1984(S59).4.14 | 縁城寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 京丹後市 | 木造扁額 額文「如意寺」 | １面 | 鎌倉 | 1992(H4).4.14 | 如意寺 |
| 府指定 | 工芸品 | 京丹後市 | 石燈籠 | １基 | 鎌倉 | 2001(H13).3.23 | 酬恩庵 |
| 府指定 | 工芸品 | 与謝野町 | 石燈籠 | １基 | 鎌倉 | 1995(H7).3.14 | 天満神社 |
| 府指定 | 書跡・典籍 | 京都市上京区 | 紺紙金字法華経 | ７帖 | 南北朝－室町 | 2005(H17).3.18 | 妙顕寺 |
| 府指定 | 書跡・典籍 | 京都市上京区 | 白紙金字法華経 | ７帖 | 南北朝－室町 | 2005(H17).3.18 | 妙顕寺 |
| 府指定 | 書跡・典籍 | 京都市左京区 | 諸国寺社縁起歓進帳類 | 121点 | 南北朝－江戸 | 2004(H16).3.19 | 曼殊院 |
| 府指定 | 書跡・典籍 | 京都市東山区 | 東福寺永明門派歴代文書墨跡 | ６幅 | 鎌倉－室町 | 2008(H20).3.21 | 永明院 |
| 府指定 | 書跡・典籍 | 京都市東山区 | 長阿含経 巻第十 | １巻 | 奈良 | 2008(H20).3.21 | 新善光寺 |
| 府指定 | 書跡・典籍 | 京都市右京区 | 光厳天皇宸翰法華経要文和歌懐紙 | １幅 | 南北朝 | 2003(H15).3.14 | 常照皇寺 |
| 府指定 | 書跡・典籍 | 大山崎町 | 紺紙銀字法華経 | ４帖 | 高麗、元 | 1987(S62).4.15 | 寶積寺 |
| 府指定 | 書跡・典籍 | 八幡市 | 紺紙金字無量寿経 | ２巻 | 平安 | 2007(H19).3.16 | 正法寺 |
| 府指定 | 書跡・典籍 | 八幡市 | 紺紙金字観無量寿経 | １巻 | 平安 | 2007(H19).3.16 | 正法寺 |
| 府指定 | 書跡・典籍 | 八幡市 | 紺紙金字阿弥陀経 | １巻 | 平安 | 2007(H19).3.16 | 正法寺 |
| 府指定 | 書跡・典籍 | 笠置町 | 大般若経 | 588帖 | 奈良－室町 | 2000(H12).3.17 | 飛鳥路区 |
| 府指定 | 書跡・典籍 | 綾部市 | 法華経 細川高国筆 | １巻 | 室町 | 2018(H30).3.23 | 安国寺 |
| 府指定 | 書跡・典籍 | 福知山市 | 桐村家伝書 | 27冊 | 室町－江戸 | 1992(H4).4.14 | 個人 |
| 府指定 | 書跡・典籍 | 福知山市 | 観音寺聖教文書類 | 2,415点 | 鎌倉－明治 | 1998(H10).3.13 | 観音寺 |
| 府指定 | 書跡・典籍 | 舞鶴市 | 金剛院聖教類 | 1,646点 | 室町－昭和 | 1994(H6).2.18 | 金剛院 |
| 府指定 | 書跡・典籍 | 宮津市 | 法華経（平登子三十三回忌供養経) | ７巻 | 室町－江戸 | 1992(H4).4.14 | 成相寺 |
| 府指定 | 書跡・典籍 | 宮津市 | 大般若経 | 591帖 | 南宋・室町・江戸 | 2002(H14).3.26 | 成相寺 |
| 府指定 | 書跡・典籍 | 伊根町 | 紙本墨書続浦嶋子伝記 | １巻 | 鎌倉 | 2022(R4).3.22 | 宇良神社 |
| 府指定 | 古文書 | 京都市上京区 | 北野天満宮古記録 | 38冊 | 鎌倉－江戸 | 2002(H14).3.26 | 北野天満宮 |
| 府指定 | 古文書 | 京都市上京区 | 古久保家文書 | 209点 | 江戸 | 2009(H21).3.24 | 京都府 |
| 府指定 | 古文書 | 京都市左京区 | 京都十六本山会合文書 | 753点 | 室町－明治 | 1990(H2).4.17 | 頂妙寺 |
| 府指定 | 古文書 | 京都市左京区 | 金戒光明寺再興歓進状 | １巻 | 室町 | 1995(H7).3.14 | 金戒光明寺 |
| 府指定 | 古文書 | 京都市左京区 | 吉田寺再興歓進状 | １巻 | 室町 | 1995(H7).3.14 | 金戒光明寺 |
| 府指定 | 古文書 | 京都市東山区 | 三聖寺伽藍図 | １幅 | 南北朝 | 1998(H10).3.31 | 東福寺 |
| 府指定 | 古文書 | 京都市東山区 | 六波羅蜜寺再興勧進状 | １巻 | 南北朝 | 1998(H10).3.31 | 六波羅蜜寺 |
| 府指定 | 古文書 | 京都市東山区 | 諸国大名寄進録 | ２巻 | 南北朝 | 1998(H10).3.31 | 六波羅蜜寺 |
| 府指定 | 古文書 | 京都市東山区 | 七条道場金光寺文書 | ８幅、３巻、８冊、66通 | 鎌倉－江戸 | 1999(H11).3.19 | 長楽寺 |
| 府指定 | 古文書 | 京都市右京区 | 長福寺文書（二百三十通） | 13巻、18幅、41通 | 鎌倉－江戸 | 1991(H3).4.19 | 長福寺 |
| 府指定 | 古文書 | 京都市右京区 | 春屋妙葩番匠木屋定 | １枚 | 南北朝 | 1996(H8).3.15 | 天龍寺 |
| 府指定 | 古文書 | 京都市右京区 | 鹿王院文書（四千六十六通） | 34幅、30巻、367冊、18帖、3441通、40鋪、2枚 | 平安－江戸 | 2005(H17).3.18 | 鹿王院 |
| 府指定 | 古文書 | 長岡京市 | 調子家文書 | 725点 | 鎌倉－明治 | 1995(H7).3.14 | 個人 |
| 府指定 | 古文書 | 長岡京市 | 寂照院金剛力士像造立結縁交名（紙背御成敗式目） | １巻 | 南北朝－室町 | 2005(H17).3.18 | 個人 |
| 府指定 | 古文書 | 大山崎町 | 井尻家文書 附 文書箱３合 文政十三年、嘉永七年及び慶応元年の墨書銘がある | 1,137点 | 鎌倉－昭和 | 2022(R4).3.22 | 個人 |
| 府指定 | 古文書 | 宇治市 | 金色院御堂再興勧進状 | １巻 | 寛正4 （1463） | 1989(H1).4.14 | 地蔵院 |
| 府指定 | 古文書 | 宇治市 | 平等院修造勧進状 | １巻 | 室町－江戸 | 1989(H1).4.14 | 浄土院 |
| 府指定 | 古文書 | 宇治市 | 平等院旧起 | １巻 | 室町－江戸 | 1989(H1).4.14 | 浄土院 |
| 府指定 | 古文書 | 八幡市 | 正法寺文書 | 9,383点 | 鎌倉－明治 | 1992(H4).4.14 | 正法寺 |
| 府指定 | 古文書 | 八幡市 | 林家文書 | 1,467点 | 南北朝－明治 | 2011(H23).3.25 | 林 泰 |
| 府指定 | 古文書 | 京田辺市 | 一休宗純関係資料 | 一括 | 室町－桃山 | 2001(H13).3.23 | 酬恩庵 |
| 府指定 | 古文書 | 木津川市 | 狛文書 | 25点 | 室町－江戸 | 2012(H24).3.23 | 個人 |
| 府指定 | 古文書 | 井手町 | 高神社文書(五通） | ４巻、１通 | 鎌倉－江戸 | 1984(S59).4.14 | 高神社 |
| 府指定 | 古文書 | 笠置町 | 笠置寺再興勧進状 | １巻 | 室町 | 1991(H3).4.19 | 笠置寺 |
| 府指定 | 古文書 | 亀岡市 | 穴太寺観音縁起 | １巻 | 南北朝－江戸 | 1997(H9).3.14 | 穴太寺 |
| 府指定 | 古文書 | 亀岡市 | 足利高氏願文 | １巻 | 南北朝－室町 | 2006(H18).3.17 | 八幡宮 |
| 府指定 | 古文書 | 亀岡市 | 遠山家文書 | 17通 | 南北朝～室町後期 | 2023(R5).3.24 | 個人 |
| 府指定 | 古文書 | 南丹市 | 制札 | ２枚 | 室町－桃山 | 1988(S63).4.15 | 生身天満宮 |
| 府指定 | 古文書 | 京丹波町 | 片山家文書（百四十七通） | ７巻、２冊、３通 | 鎌倉－江戸 | 1985(S60).5.15 | 個人 |
| 府指定 | 古文書 | 京丹波町 | 制札 | １枚 | 南北朝－室町 | 1988(S63).4.15 | 大福光寺 |
| 府指定 | 古文書 | 綾部市 | 光明寺本堂再興勧進状 | １巻 | 室町 | 2019(H31).3.29 | 光明寺 |
| 府指定 | 古文書 | 綾部市 | 光明寺奉加帳 | １帖 | 室町 | 2019(H31).3.29 | 光明寺 |
| 府指定 | 古文書 | 福知山市 | 天寧寺文書(二十七通） | ３巻、２通 | 室町－江戸 | 1986(S61).4.15 | 天寧寺 |
| 府指定 | 古文書 | 福知山市 | 大中臣氏略系図 | １巻 | 鎌倉 | 1991(H3).4.19 | 個人 |
| 府指定 | 古文書 | 福知山市 | 桐村家文書(八通） | １巻 | 室町 | 1991(H3).4.19 | 個人 |
| 府指定 | 古文書 | 福知山市 | 愚中周及・大中臣実宗連署禁制 | １枚 | 室町 | 1996(H8).3.15 | 天寧寺 |
| 府指定 | 古文書 | 舞鶴市 | 梅垣西浦文書（百二十八通） | ４巻 | 鎌倉－江戸 | 1987(S62).4.15 | 個人 |
| 府指定 | 古文書 | 舞鶴市 | 制札 | １枚 | 南北朝－江戸 | 1988(S63).4.15 | 金剛院 |
| 府指定 | 古文書 | 舞鶴市 | 松尾寺再興啓白文 | １巻 | 鎌倉－室町 | 1989(H1).4.14 | 松尾寺 |
| 府指定 | 古文書 | 宮津市 | 成相寺文書・制札 | ６通・４枚 | 室町－江戸 | 1995(H7).3.14 | 成相寺 |
| 府指定 | 古文書 | 宮津市 | 九世戸縁起 | １巻 | 室町 | 1997(H9).3.14 | 智恩寺 |
| 府指定 | 古文書 | 宮津市 | 九世戸智恩寺幹縁疏并序 | １巻 | 室町 | 1997(H9).3.14 | 智恩寺 |
| 府指定 | 古文書 | 宮津市 | 三上家文書 | 13,027点 | 室町－昭和 | 2001(H13).3.23 | 個人 |
| 府指定 | 古文書 | 宮津市 | 籠神社文書 | ２巻 | 鎌倉・室町・江戸 | 2003(H15).3.14 | 籠神社 |
| 府指定 | 古文書 | 宮津市 | 北野宮再興勧進状 | １巻 | 室町 | 2018(H30).3.23 | 個人 |
| 府指定 | 古文書 | 宮津市 | 加藤家文書 | 4571点 | 江戸～昭和 | 2023(R5).3.24 | 個人 |
| 府指定 | 古文書 | 京丹後市 | 圓頓寺惣門再興勧進状 | １巻 | 室町 | 1991(H3).4.19 | 圓頓寺 |
| 府指定 | 古文書 | 伊根町 | 浦嶋社・宇良神社棟札類 | 10枚 | 室町－明治 | 2014(H26).3.24 | 宇良神社 |
| 府指定 | 古文書 | 伊根町 | 七所社修造棟札 | １枚 | 室町 | 2014(H26).3.24 | 七神社 |
| 府指定 | 古文書 | 伊根町 | 筒河庄菅野村荒神社上葺造営之記（木札） | １枚 | 室町 | 2014(H26).3.24 | 上山神社 |
| 府指定 | 古文書 | 伊根町 | 津母八坂神社棟札類 | 11枚 | 室町－江戸 | 2017(H29).3.17 | 八坂神社 |
| 府指定 | 考古資料 | 京都市上京区 | 袈裟襷文銅鐸 | ４口 | 弥生 | 1984(S59).4.14 | 京都府 |
| 府指定 | 考古資料 | 京都市上京区 | 大道寺経塚出土品 | 鎌倉 | 1988(S63).4.15 | 京都府 | |
| 府指定 | 考古資料 | 京都市上京区 | 奉安塚古墳出土品 | 古墳 | 1990(H2).4.17 | 京都府 | |
| 府指定 | 考古資料 | 京都市上京区 | 奉安塚古墳出土品 | 古墳 | 1990(H2).4.17 | 国立大学法人京都大学 | |
| 府指定 | 考古資料 | 京都市上京区 | 奈具岡北1号墳出土品 | 一括 | 古墳 | 2001(H13).3.23 | 京都府 |
| 府指定 | 考古資料 | 京都市上京区 | 家形埴輪 土辺古墳出土 | １点 | 古墳 | 2004(H16).3.19 | 京都府 |
| 府指定 | 考古資料 | 京都市上京区 | 人面付壺形土器 顔面部片 | １点 | 古墳 | 2006(H18).3.17 | 京都府 |
| 府指定 | 考古資料 | 京都市上京区 | 水祭祀遺物（浅後谷南遺跡出土） | 18点 | 古墳 | 2007(H19).3.16 | 京都府 |
| 府指定 | 考古資料 | 京都市上京区 | 金比羅山古墳出土品 | 古墳 | 2021(R3).3.30 | 京都府 | |
| 府指定 | 考古資料 | 京都市上京区 | 冑山１号墳出土品 | 古墳 | 2022(R4).3.22 | 京都府 | |
| 府指定 | 考古資料 | 京都市中京区 | 愛宕山古墳出土品 | 古墳 | 1986(S61).4.15 | 京都市 | |
| 府指定 | 考古資料 | 向日市 | 物集女車塚古墳出土品 | 古墳 | 2018(H30).3.23 | 向日市 | |
| 府指定 | 考古資料 | 長岡京市 | 恵解山古墳出土品 | 古墳 | 1999(H11).3.19 | 長岡京市 | |
| 府指定 | 考古資料 | 大山崎町 | 山崎廃寺出土品 | 飛鳥－平安 | 2018(H30).3.23 | 大山崎町 | |
| 府指定 | 考古資料 | 宇治市 | 二子山古墳出土品 | 一括 | 古墳 | 1994(H6).2.18 | 宇治市 |
| 府指定 | 考古資料 | 宇治市 | 浮島十三重塔納置品 | 平安－室町 | 2003(H15).3.14 | 報生院 | |
| 府指定 | 考古資料 | 宇治市 | 白川金色院経塚遺物 | 61点 | 平安－室町 | 2009(H21).3.24 | 宇治市 |
| 府指定 | 考古資料 | 八幡市 | 石清水八幡宮境内出土品 | 江戸 | 2018(H30).3.23 | 石清水八幡宮 | |
| 府指定 | 考古資料 | 京田辺市 | 家形石棺（堀切谷第六号横穴出土） | １合 | 古墳 | 1993(H5).4.9 | 京田辺市 |
| 府指定 | 考古資料 | 木津川市 | 埴輪（上人ヶ平古墳群・上人ヶ平埴輪窯跡群出土） | 古墳 | 2018(H30).3.23 | 木津川市 | |
| 府指定 | 考古資料 | 井手町 | 井手寺跡出土瓦 | 奈良 | 2018(H30).3.23 | 井手町 | |
| 府指定 | 考古資料 | 南丹市 | 黒田古墳出土品 | 一括 | 古墳 | 1998(H10).3.13 | 南丹市 |
| 府指定 | 考古資料 | 京丹波町 | 巫女埴輪（塩谷五号墳出土） | ２軀 | 古墳 | 1991(H3).4.19 | 京丹波町 |
| 府指定 | 考古資料 | 京丹波町 | 蒲生野古墳出土品 | 古墳 | 2020(R2).3.27 | 京丹波町 | |
| 府指定 | 考古資料 | 綾部市 | 私市円山古墳出土品 | 一括 | 古墳 | 2004(H16).3.19 | 綾部市 |
| 府指定 | 考古資料 | 福知山市 | 草創期縄文土器深鉢（武者ヶ谷遺跡出土） | １点 | 縄文 | 2018(H30).3.23 | 福知山市 |
| 府指定 | 考古資料 | 福知山市 | 高田山経塚出土品 | 鎌倉 | 2018(H30).3.23 | 福知山市 | |
| 府指定 | 考古資料 | 福知山市 | ヌクモ２号墳出土品 | 古墳 | 2019(H31).3.29 | 福知山市 | |
| 府指定 | 考古資料 | 舞鶴市 | 広口壺及び貝製品（志高遺跡出土） | 弥生 | 2018(H30).3.23 | 舞鶴市 | |
| 府指定 | 考古資料 | 宮津市 | 籠神社経塚出土品 | 鎌倉 | 1989(H1).4.14 | 籠神社 | |
| 府指定 | 考古資料 | 宮津市 | 成相寺旧境内出土品 | 室町 | 2018(H30).3.23 | 成相寺 | |
| 府指定 | 考古資料 | 宮津市 | 波路古墳出土品 | 古墳 | 2018(H30).3.23 | 宮津市 | |
| 府指定 | 考古資料 | 京丹後市 | 銅経筒 | １口 | 平安 | 1988(S63).4.15 | 圓頓寺 |
| 府指定 | 考古資料 | 京丹後市 | 大田南二号墳出土品 | 一括 | 古墳 | 1996(H8).3.15 | 京丹後市 |
| 府指定 | 考古資料 | 京丹後市 | 三坂神社墳墓群出土品 | 一括 | 弥生 | 2000(H12).3.17 | 京丹後市 |
| 府指定 | 考古資料 | 京丹後市 | 赤坂今井墳墓出土品 | 一括 | 弥生 | 2010(H22).3.23 | 京丹後市 |
| 府指定 | 考古資料 | 京丹後市 | 左坂経塚出土品 | 平安－鎌倉 | 2018(H30).3.23 | 京丹後市 | |
| 府指定 | 考古資料 | 京丹後市 | 離湖古墳出土品 | 古墳 | 2019(H31).3.29 | 京丹後市 | |
| 府指定 | 考古資料 | 与謝野町 | 人面付土器頭部片（温江遺跡出土） | １点 | 弥生 | 2013(H25).3.19 | 与謝野町 |
| 府指定 | 考古資料 | 与謝野町 | 舟形石棺 蛭子山１号墳出土 | １合 | 古墳 | 2019(H31).3.29 | 与謝野町 |
| 府指定 | 歴史資料 | 京都市上京区 | 京都盲唖院関係資料 | 45点 | 江戸－大正 | 1990(H2).4.17 | 京都府 |
| 府指定 | 歴史資料 | 京都市上京区 | 皆川家天文暦道関係資料 | 一括 | 室町－明治 | 1999(H11).3.19 | 大将軍八神社 |
| 府指定 | 歴史資料 | 京都市左京区 | 袋中上人関係資料 | 一括 | 桃山・江戸・古琉球 | 2003(H15).3.14 | 檀王法林寺 |
| 府指定 | 歴史資料 | 京都市東山区 | 清水寺参詣曼荼羅 | １幅 | 室町 | 1997(H9).3.14 | 清水寺 |
| 府指定 | 歴史資料 | 京都市東山区 | 珍皇寺参詣曼荼羅 | １幅 | 桃山 | 1997(H9).3.14 | 六道珍皇寺 |
| 府指定 | 歴史資料 | 京都市西京区 | 善峰寺参詣曼荼羅 | １幅 | 室町 | 1996(H8).3.15 | 善峯寺 |
| 府指定 | 歴史資料 | 京都市西京区 | 三鈷寺参詣曼荼羅図 | １幅 | 室町 | 1996(H8).3.15 | 善峯寺 |
| 府指定 | 歴史資料 | 京都市西京区 | 法輪寺参詣曼荼羅 | １幅 | 桃山 | 1998(H10).3.13 | 法輪寺 |
| 府指定 | 歴史資料 | 木津川市 | 曳覆曼荼羅版木 | ２枚 | 室町 | 2005(H17).3.18 | 西明寺 |
| 府指定 | 歴史資料 | 亀岡市 | 法常寺一絲文守他歴代関係資料 | 一括（337点） | 江戸 | 1995(H7).3.14 | 法常寺 |
| 府指定 | 歴史資料 | 亀岡市 | 特芳禅傑関係資料 | 21点 | 室町・江戸 | 2002(H14).3.26 | 龍潭寺 |
| 府指定 | 歴史資料 | 亀岡市 | 亀山藩史料 | 198点 | 江戸－明治 | 2010(H22).3.23 | 亀岡市 |
| 府指定 | 歴史資料 | 宮津市 | 成相寺参詣曼荼羅 | １幅 | 室町 | 1996(H8).3.15 | 成相寺 |
| 府指定 | 歴史資料 | 京丹後市 | 玄圃霊三関係資料 | ２巻、９幅、６冊、19通 | 桃山－江戸 | 1999(H11).3.19 | 宗雲寺 |
| 府登録 | 絵画 | 木津川市 | 紙本著色狛秀綱像 | １幅 | 桃山 | 1987(S62).4.15 | 西福寺 |
| 府登録 | 絵画 | 京丹後市 | 方丈障壁画 長沢芦洲筆 | 44面 | 江戸 | 1983(S58).4.15 | 慶徳院 |
| 府登録 | 絵画 | 京丹後市 | 絹本著色釈迦十六善神像 | １幅 | 鎌倉 | 1983(S58).4.15 | 岩屋寺 |
| 府登録 | 絵画 | 京丹後市 | 絹本著色地蔵菩薩像 | １幅 | 鎌倉 | 1983(S58).4.15 | 岩屋寺 |
| 府登録 | 絵画 | 京丹後市 | 絹本著色五大尊像 | １幅 | 鎌倉 | 1983(S58).4.15 | 岩屋寺 |
| 府登録 | 絵画 | 京丹後市 | 絹本著色毘沙門天像 | １幅 | 鎌倉 | 1983(S58).4.15 | 岩屋寺 |
| 府登録 | 絵画 | 京丹後市 | 紙本著色斎明神縁起 | １巻 | 江戸 | 1991(H3).4.19 | 竹野神社 |
| 府登録 | 絵画 | 京丹後市 | 紙本著色等楽寺縁起 | １巻 | 桃山 | 1991(H3).4.19 | 竹野神社 |
| 府登録 | 彫刻 | 京都市東山区 | 木造毘沙門天立像 | １軀 | 鎌倉 | 2014(H26).3.24 | 霊源院 |
| 府登録 | 彫刻 | 京田辺市 | 木造大応国師坐像 | １軀 | 室町 | 1985(S60).5.15 | 酬恩庵 |
| 府登録 | 彫刻 | 木津川市 | 木造十王坐像 | 10軀 | 室町 | 1984(S59).4.14 | 常念寺 |
| 府登録 | 彫刻 | 木津川市 | 木造倶生神半跏像 | ２軀 | 室町 | 1984(S59).4.14 | 常念寺 |
| 府登録 | 彫刻 | 木津川市 | 木造奪衣婆坐像 | １軀 | 室町 | 1984(S59).4.14 | 常念寺 |
| 府登録 | 彫刻 | 木津川市 | 当尾磨崖仏 | 鎌倉 | 1985(S60).5.15 | 浄瑠璃寺 | |
| 府登録 | 彫刻 | 木津川市 | 木造日光菩薩立像 | １軀（２軀） | 室町 | 1987(S62).4.15 | 西念寺 |
| 府登録 | 彫刻 | 木津川市 | 木造月光菩薩立像 | １軀（２軀） | 室町 | 1987(S62).4.15 | 西念寺 |
| 府登録 | 彫刻 | 井手町 | 木造獅子頭 | １面 | 鎌倉 | 1984(S59).4.14 | 高神社 |
| 府登録 | 彫刻 | 京丹波町 | 木造熊野十二所権現本地仏像 | 12軀 | 平安 | 1990(H2).4.17 | 新宮寺 |
| 府登録 | 彫刻 | 綾部市 | 木造随身坐像 | ２軀 | 室町 | 1986(S61).4.15 | 室尾谷神社 |
| 府登録 | 彫刻 | 福知山市 | 木造春日明神坐像 | １軀 | 南北朝－室町 | 1986(S61).4.15 | 佐々木神社 |
| 府登録 | 工芸品 | 木津川市 | 絵仏供 | 11個 | 室町－近代 | 1988(S63).4.15 | 浄瑠璃寺 |
| 府登録 | 工芸品 | 亀岡市 | 梵鐘 | １口 | 室町 | 1983(S58).4.15 | 桂林寺 |
| 府登録 | 工芸品 | 亀岡市 | 石造御正体 | ４面 | 鎌倉 | 1983(S58).4.15 | 真神寺 |
| 府登録 | 工芸品 | 南丹市 | 木造懸仏 | ３面 | 鎌倉 | 1983(S58).4.15 | 浄光寺 |
| 府登録 | 工芸品 | 南丹市 | 懸仏 | 139面 | 鎌倉－室町 | 1983(S58).4.15 | 普門院 |
| 府登録 | 工芸品 | 京丹波町 | 懸仏 | 15面 | 鎌倉－室町 | 1988(S63).4.15 | 大福光寺 |
| 府登録 | 工芸品 | 福知山市 | 懸仏 | ６面 | 室町 | 1987(S62).4.15 | 如来院 |
| 府登録 | 工芸品 | 福知山市 | 懸仏 | 32面、１軀 | 平安－室町 | 1987(S62).4.15 | 熊野神社 |
| 府登録 | 工芸品 | 宮津市 | 金銅装笈 | １背 | 室町 | 1984(S59).4.14 | 成相寺 |
| 府登録 | 書跡・典籍 | 南丹市 | 立花図巻三十三図 | １巻 | 江戸 | 2000(H12).3.17 | 如意寺 |
| 府登録 | 古文書 | 京田辺市 | 大徳寺文書 | 247点 | 室町－昭和 | 1987(S62).4.15 | 大徳寺 |
| 府登録 | 古文書 | 久御山町 | 東明寺文書 | 142点 | 南北朝－江戸 | 1988(S63).4.15 | 称名寺 |
| 府登録 | 古文書 | 南山城村 | 宮本座文書 | 266点 | 室町－昭和 | 1987(S62).4.15 | 宮本座 |
| 府登録 | 古文書 | 綾部市 | 制札 | ２枚 | 室町 | 1988(S63).4.15 | 光明寺 |
| 府登録 | 古文書 | 舞鶴市 | 阿良須神社文書(十六通） | ３巻 | 南北朝－江戸 | 1983(S58).4.15 | 阿良須神社 |
| 府登録 | 古文書 | 舞鶴市 | 金剛院文書 | 839点 | 南北朝－昭和 | 1993(H5).4.9 | 金剛院 |
| 府登録 | 古文書 | 宮津市 | 国分寺略縁起 | １帖 | 江戸 | 1993(H5).4.9 | 国分寺 |
| 府登録 | 古文書 | 京丹後市 | 本願寺文書 | 14通 | 鎌倉－江戸 | 1993(H5).4.9 | 本願寺 |
| 府登録 | 考古資料 | 京丹後市 | カジヤ古墳出土品 第一主体部出土品 | 古墳 | 1987(S62).4.15 | 京丹後市 | |
| 府登録 | 考古資料 | 京丹後市 | カジヤ古墳出土品 第三主体部出土品 | 古墳 | 1987(S62).4.15 | 京丹後市 | |
| 府登録 | 考古資料 | 京丹後市 | カジヤ古墳出土品 第四主体部出土品 | 古墳 | 1987(S62).4.15 | 京丹後市 | |
| 府登録 | 歴史資料 | 京都市上京区 | 北丹後地震写真ガラス乾板 | 昭和 | 2012(H24).3.23 | 京都府 | |
| 府登録 | 歴史資料 | 城陽市 | 旅籠松屋関係資料 | 江戸－明治 | 1987(S62).4.15 | 個人 |